Основные сюжетные линии игры
1. Неорганическая жизнь Альбирео
На планете Альбирео обитали три формы разумной неорганической жизни: микроботы - летающие микрокристаллы, способные соединяться в сложные соединения для выполнения разных задач (описанные в «Непобедимом» С.Лема), медленно передвигающиеся пирамидки и неподвижный Мозг в глубине планеты. Все они образовывали единый гигантский Разум, хотя любая часть этого роя была способна существовать независимо. Все они являлись результатом небиологической эволюции первоначального Искусственного Интеллекта автопилота «Непобедимого», перед которым гибнущие в жестком излучении Альбирео колонисты поставили задачу создать наиболее жизнеспособные формы кибернетической жизни для сохранения информации о колонистах и передаче ее в дальнейшем другим людям. При этом они оставили будущему разуму три тестовых критерия «людей»:
Первый тест – проверка логического мышления, позволяющего обнаруживать закономерности и разгадывать шифры. Прошедшие первый тест считались роботами, инопланетянами или людьми.
Второй тест отсеивал роботов – он требовал демонстрации способности к нарушению собственных жизненных принципов. После прохождения этого теста Разум соглашался начинать общение с индивидуумом и делится с ним частью своей информации. На начало игры этот тест прошла Элен Висконти, в процессе игры к ней присоединились Дио Антеро, Ангела Верхова и Альфаран Мауро.
Третий тест отсеивал «инопланетян», проверяя наличие альтруистической этики – готовности делится любой информацией просто так, без каких-либо условий, и просить аналогичной помощи в случае возникновения проблем – в лучших традициях Комкона-1 «Полдня XXII век» А.и Б.Стругацких.
На Сигму Кита Элен Висконти доставила (с их разрешения) 35 микроботов в пробирке. Еще 29 микроботов и пирамидку доставили туда бетанцы. Все они, соединившись также с Кориаланом – аналогичным созданием Дио Антеро – составили местный Разум, имеющий достаточно высокие возможности в области обработки информации и распространения, перехвата и дешифровки сигналов.

2. Чемоданчик Кера Дюбаэра
Еще до событий «Дип.иммунитета» сатрап-губернатор Сигмы Кита Аддин Аюб Джияджи находился в заговоре с Кером Дюбаэром – он планировал получить копию банка генетических данных аутов и отделиться от Цетаганды. Впоследствии Кэр Дюбаэр избрал более радикальный путь действий, однако чемодан с генными материалами сатрап-губернатору все-таки отослал – через Архипелаг Джексона. Информация об этом случайно попала к Императору Барраяра Грегору Форбарра, вследствие чего сатрап-губернатор (под именем своего секретаря Вальда Кея) был вынужден тайно встречаться с Грегором на нейтральной территории, чтобы обсудить условия, на которых Грегор не станет сообщать об этом Императору Цетаганды. В дальнейшем это послужило основанием для подозрений в отношении гем-майора СБ Вальда Кея.
На следы утерянных генных материалов в конце концов вышел гем-генерал Бенин. По заданию его и Звездных Яслей на Сигму Кита были отправлены ба Каури и гем-полковник СБ Анджей Террини, в задачу которых входил поиск утерянных генных материалов и возвращение их в Звездные Ясли.

3. Заговор гем-генералов
Тем временем в Цетагандийской Империи созрел заговор большой части гем-генералов, планировавших уравнять гемов в правах с аутами. По сигналу с Эты Кита гем-генералы во всех сатрапиях должны были взять власть в свои руки. Переворот, случившийся в начале игры на Эте Кита, удался не полностью – Звездные Ясли остались под властью Императрицы, т.е. гемы не получили самой большой ценности Цетаганды – генных материалов аутов. В результате дубликат генного банка аутов, находящийся в руках у сатрап-губернатора Сигмы Кита, оказался тем объектом, от которого зависела судьба переворота:
- попадание его в руки гем-генералов означало полный успех переворота;
- сохранение его в руках аутов Сигмы Кита привело бы к возвращению Цетаганды под власть Императора Флетчира Джияджи (в этом случае Сигма Кита имела бы шанс отделиться);
- на Сигме Кита присутствовали гемы, преданные сатрап-губернатору Кси Кита Имрэ Ронду, который был в курсе заговора и использовал его в личных целях. Доставление ими генного банка на Кси Кита (что в результате и произошло) приводило к возвращению Цетаганды под власть аутов в лице нового Императора Имрэ Ронда.
Таким образом, на время игры Сигма Кита также становилась «ничьей планетой», а события на ней в миниатюре отображали события на всей Цетаганде.